L’Acadèmia és regida per la Junta Directiva (també anomenada Comissió General Directiva) que està formada pel President, el Vicepresident, el Secretari General, el Vicesecretari General, el Tresorer, el Comptador, el Conservador, el Bibliotecari, els Directors de les Seccions i el Director de l’Observatori Fabra.